Το Τμήμα, από την έναρξη λειτουργίας τους, υποστηρίχθηκε και χρηματοδοτήθηκε από τα έργα του «Επιχειρησιακού Προγράμματος Εκπαίδευσης και Αρχικής Επαγγελματικής Κατάρτισης, (ΕΠΕΑΕΚ Ι & ΙΙ)» του Υπ.Ε.Π.Θ. μέσω του Β’ και Γ’ ΚΠΣ. Οι πράξεις αυτές συγχρηματοδοτήθηκαν κατά 25% από εθνικούς πόρους και κατά 75% από το Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο (ΕΚΤ) και του Ευρωπαϊκού Ταμείου Περιφερικής Ανάπτυξης (ΕΤΠΑ), της Ευρωπαϊκής Ένωσης.
Συγκεκριμένα μέχρι σήμερα το Τμήμα έχει χρηματοδοτηθεί από τα παρακάτω έργα για το Π.Π.Σ. και το Π.Μ.Σ.:
- «Διεύρυνση της Τριτοβάθμιας Εκπαίδευσης – Παν. Θεσσαλίας» (ΕΚΤ) (1/2000-8/2000)
- «Διεύρυνση της Τριτοβάθμιας Εκπαίδευσης – Παν. Θεσσαλίας (2001-2004)» (ΕΚΤ) (9/2000-8/2004)
- «Ενίσχυση Σπουδών Πληροφορικής στο ΤΗΜΜΥ του Π.Θ.» (ΕΚΤ) (9/2002-8/2008)
- «Πρακτική Άσκηση φοιτητών του Π.Θ. (Β’ φάση)» (ΕΚΤ) (9/2001-12/2005)
- «Πρακτική Άσκηση φοιτητών του Π.Θ. (Γ’ φάση)» (ΕΚΤ) (1/2006-12/2008)
Για δε τον εξοπλισμό του, από τα κάτωθι προγράμματα:
- «Εξοπλισμός για την υποστήριξη Πράξεων ΕΚΤ- Διεύρυνση της Τριτοβάθμιας Εκπαίδευσης, Παν. Θεσσαλίας (2001-2003)» (ΕΤΠΑ) (2002-2004)
- «Ενίσχυση των ΤΠΕ του Παν. Θεσσαλίας» (ΕΤΠΑ) (2003-2008).