ΜΔΕ609 Βιοπληροφορική

Εισαγωγή στην μοριακή Βιολογία,Χαρτογράφηση θέσεων περιορισμού, Ρυθμιστικά μοτίβα σε αλληλουχίες DNA, Προφίλ, ΕύρεσηΜοτίβων, Γονιδιωματικέςαναδιατάξεις και προσεγγιστικοί αλγόριθμοι, στοίχισηαλληλουχιών DNA και δυναμικός προγραμματισμός, ανεύρεση γονιδίων, ανάλυση έκφρασης γονιδίων, εξελικτικά δένδρα και ιεραρχική ομαδοποίηση , μη κωδικό RNA, βάσεις ανθρωπίνων βιολογικών δεδομένων, εισαγωγή στην γλώσσα προγραμματισμού PERL.

Το μάθημα αποτελεί την βασική εισαγωγή στις έννοιες της Υπολογιστικής Βιολογίας και της Βιοπληροφορικής
Ή ύλη του μαθήματος στοχεύει στην εισαγωγή των σπουδαστών στις έννοιες της βιολογίας και της δυνατότητα ανάλυσης βιολογικών δεδομένων. Θεωρώντας τα βιολογικά δεδομένα (DNA, RNA, πρωτεΐνες) ως ψηφιακή πληροφορία, εφαρμόζει αλγορίθμους για την επεξεργασία τους και την παραγωγή χρήσιμων συμπερασμάτων με αποδοτικό τρόπο.

Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος ο φοιτητής / τρια θα είναι σε θέση να:

• Έχει κατανοήσει τις βασικές έννοιες της Βιολογίας και Υπολογιστικής Βιολογίας
• Έχει γνώση των μεθόδων και τεχνικών για την μετατροπή βιολογικών δεδομένων σε ψηφιακή πληροφορία.
• Είναι σε θέση να εφαρμόσει υπολογιστικούς αλγόριθμους για την επίλυση βιολογικών δεδομένων.
• Έχει μάθει να συνθέτει υπολογιστικές λύσεις για βιολογικά προβλήματα.
• Έχει μάθει να αξιολογεί υπολογιστικά αποτελέσματα ως προς την χρησιμότητα τους στην μοριακή βιολογία και στην έρευνα στην γενετική.